Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Ccdc113Q8C5T8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc113Q8C5T8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc113Q8C5T8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc113Q8C5T8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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