Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L7

Rbm34, RNA-binding protein 34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm34Q8C5L7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbm34Q8C5L7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm34Q8C5L7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms