Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pggt1bQ8BUY9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms