Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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