Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bnc2Q8BMQ3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms