Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem260Q8BMD6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem260Q8BMD6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms