Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc2Q8BKV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms