Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Necab1Q8BG18 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms