Protein–RNA interactions for Protein: Q810R8

Gm20738, Predicted gene, 20738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20738Q810R8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm20738Q810R8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm20738Q810R8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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