Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm2Q80W85 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm2Q80W85 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms