Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pcsk9Q80W65 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms