Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SnupnQ80W37 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SnupnQ80W37 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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