Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc39a4Q78IQ7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms