Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PdgfrlQ6PE55 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PdgfrlQ6PE55 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms