Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms