Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna3Q65CL1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms