Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itga3Q62470 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms