Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six1Q62231 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six1Q62231 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six1Q62231 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six1Q62231 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms