Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema3cQ62181 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Sema3cQ62181 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Sema3cQ62181 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Sema3cQ62181 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema3cQ62181 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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