Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lama3Q61789 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lama3Q61789 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama3Q61789 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms