Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna2Q61301 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms