Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ItgaeQ60677 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgaeQ60677 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms