Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CttnQ60598 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms