Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tnfsf15Q5UBV8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms