Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc1Q5NCF2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms