Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam208bQ5DTT3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms