Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrig2Q52KR2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrig2Q52KR2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms