Protein–RNA interactions for Protein: Q505D9

Trim67, Tripartite motif-containing protein 67, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim67Q505D9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim67Q505D9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim67Q505D9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms