Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm44Q3V089 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm44Q3V089 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms