Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pfdn4Q3UWL8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pfdn4Q3UWL8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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