Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q3UPC7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms