Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cops9Q3U898 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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