Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hhla1Q3TYV2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms