Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gdpd4Q3TT99 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gdpd4Q3TT99 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gdpd4Q3TT99 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gdpd4Q3TT99 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd4Q3TT99 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gdpd4Q3TT99 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gdpd4Q3TT99 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gdpd4Q3TT99 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gdpd4Q3TT99 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gdpd4Q3TT99 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gdpd4Q3TT99 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd4Q3TT99 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms