Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms