Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cul4aQ3TCH7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms