Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgap9Q1HDU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgap9Q1HDU4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms