Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myo3bQ1EG27 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myo3bQ1EG27 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms