Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Perm1Q149B8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Perm1Q149B8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Perm1Q149B8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Perm1Q149B8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms