Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne7Q0VE82 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne7Q0VE82 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms