Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms