Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox8Q04886 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox8Q04886 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms