Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top1Q04750 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms