Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Emx2Q04744 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms