Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tff2Q03404 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms