Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb4Q02738 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb4Q02738 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms