Protein–RNA interactions for Protein: P99024

Tubb5, Tubulin beta-5 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb5P99024 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb5P99024 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb5P99024 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms