Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx1P83917 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx1P83917 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms