Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irx2P81066 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Irx2P81066 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms