Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb4bP68372 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb4bP68372 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms